Soutenance de thèse de Mariema SARR

Ecole Doctorale
Sciences de la Vie et de la Santé
Spécialité
Biologie-Santé - Spécialité Maladies Infectieuses
établissement
Aix-Marseille Université
Mots Clés
Malnutrition aigue sévère,Lait maternel,Listeria monocytogenes,Probiotiques,
Keywords
Severe acute malnutrition,Breast milk,Listeria monocytogenes,Probiotics,
Titre de thèse
Etude de Listeria monocytogenes associée à la malnutrition aiguë sévère au Sénégal et potentielles implications thérapeutiques
Study of Listeria monocytogenes associated with severe acute malnutrition in Senegal and potential therapeutic implications
Date
Vendredi 26 Novembre 2021
Adresse
IHU Mediterrannée Infection 19-21 Boulevard Jean Moulin 13005 Marseille
salle 8
Jury
Directeur de these M. Matthieu MILLION Aix Marseille Université (AMU)
CoDirecteur de these M. Cheikh SOKHNA Université Cheikh Anta Diop (UCAD)
Rapporteur M. Michel CARLES AMU
Rapporteur Mme Halimatou DIOP UCAD
Examinateur Mme Laurence CAMOIN AMU
Examinateur M. Eric ADEHOSSI UCAD

Résumé de la thèse

La malnutrition aiguë sévère (MAS) est un problème de santé publique mondial qui est impliqué dans la mortalité infantile dans les pays en voies de développement. Bien qu'elle ne soit pas encore totalement comprise, cette pathologie multifactorielle a été associée, à des facteurs alimentaires, socio-environnementaux, économiques, y compris un allaitement maternel dysfonctionnel et à un microbiote intestinal altéré. La détection fortuite de Listeria monocytogenes dans le lait maternel de femmes saines au Mali dans une zone endémique de malnutrition et son absence dans une cohorte de 144 femmes allaitantes françaises n'était positive, suggérant une spécificité géographique et une potentielle implication dans la pathogenèse de la malnutrition aiguë sévère. Pour vérifier cette hypothèse, nous avons mené une étude cas-contrôle au Sénégal (incluant des enfants de moins de 5 ans et leur mère) sur la dysbiose associée à la MAS et collecté des échantillons de lait maternel et de selles chez les femmes allaitantes ainsi que des échantillons de selles et d’urines chez les enfants. Pour étudier la potentielle implication de L. monocytogenes dans la MAS, la présence de cette dernière a été évaluée dans le lait maternel de femmes sénégalaises asymptomatiques de notre cohorte ainsi que dans deux cas d’avortement spontané en utilisant des méthodes indépendantes et dépendantes de la culture. Notre étude confirme la présence de L. monocytogenes dans le lait maternel des femmes sénégalaises avec une abondance relative significativement accrue chez les mères d’enfants atteints de MAS. Par ailleurs, L. monocytogenes a été détectée dans les deux cas d’avortement spontané étudiés. Cependant, l’utilisation du lait maternel des mères d’enfants sains suffisait à induite in vitro une inhibition de la croissance de L. monocytogenes ainsi que celle de potentiels probiotiques isolés du lait maternel (Lactobacillus paracasei, Lactobacillus salivarius et Streptococcus salivarius). Une inhibition similaire a également été obtenue par l’utilisation de yaourts lyophilisés. Parmi ces derniers seul la souche Lactobacillus paracasei isolée d’un produit lacté sur 17 analysés dont 9 de France et 8 du Sénégal inhibe aussi L. monocytogenes. De façon frappante, notre étude nous a conduit à redécouvrir le potentiel probiotique tel que Lactobacillus paracasei déjà démontrée dans PNAS/Occam’s razor contre L. monocytogenes [1]. Par ailleurs, l’analyse du microbiote urinaire par approche de culturomics a permis de mettre en évidence la perte de potentiels probiotiques, en particulier du genre Bifidobacterium, chez les enfants atteints de MAS. Ce travail met en évidence une prévalence endémique de L. monocytogenes dans le lait maternel des femmes d’Afrique de l’Ouest. De plus, l’'effet inhibiteur de L. monocytogenes obtenu par l’utilisation d'espèces bactériennes lactiques isolées du lait maternel et de yaourts, conduit à proposer l’introduction de Lactobacillus paracasei (inhibitrice et isolé au Sénégal) dans les produits alimentaires pour une large consommation au Sénégal et en Afrique de l’Ouest, pourrait fournir de nouvelles options thérapeutiques peu coûteuses pour prévenir et traiter les fausses couches et alléger le fardeau de la MAS au Sénégal. Mot clés : Malnutrition aigüe sévère, Lait maternel, Urines, Listeria monocytogenes and Probiotiques.

Thesis resume

Severe acute malnutrition (SAM) is a global public health problem that is implicated in child mortality in developing countries. Although not yet fully understood, this multifactorial condition has been associated with dietary, socio-environmental and economic factors, including dysfunctional breastfeeding and altered gut microbiota. The incidental detection of Listeria monocytogenes in the breast milk of healthy women in Mali in a malnutrition endemic area and its absence in a cohort of 144 French breastfeeding women was positive, suggesting geographical specificity and potential involvement in the pathogenesis of severe acute malnutrition. To test this hypothesis, we conducted a case-control study in Senegal (including children under 5 years of age and their mothers) on dysbiosis associated with SAM and collected breast milk and stool samples from lactating women and stool and urine samples from children. To investigate the potential involvement of L. monocytogenes in SAM, the presence of L. monocytogenes was assessed in the breast milk of asymptomatic Senegalese women from our cohort as well as in two cases of spontaneous abortion using independent and culture-dependent methods. Our study confirms the presence of L. monocytogenes in the breast milk of Senegalese women with a significantly increased relative abundance in mothers of children with SAM. In addition, L. monocytogenes was detected in both cases of spontaneous abortion studied. However, the use of breast milk from mothers of healthy children was sufficient to induce in vitro inhibition of the growth of L. monocytogenes as well as that of potential probiotics isolated from breast milk (Lactobacillus paracasei, Lactobacillus salivarius and Streptococcus salivarius). Similar inhibition was also achieved using lyophilized yoghurts. Of these, only the Lactobacillus paracasei strain isolated from one of the 17 dairy products analysed, 9 from France and 8 from Senegal, also inhibited L. monocytogenes. Strikingly, our study led us to rediscover the probiotic potential of Lactobacillus paracasei, already demonstrated in PNAS/Occam's razor against L. monocytogenes [1]. Furthermore, the analysis of the urinary microbiota by culturomics approach revealed the loss of potential probiotics, in particular of the genus Bifidobacterium, in children with SAM. This work shows an endemic prevalence of L. monocytogenes in the breast milk of West African women. In addition, the inhibitory effect of L. monocytogenes obtained through the use of lactic acid bacterial species isolated from breast milk and yoghurt, leads to propose the introduction of Lactobacillus paracasei (inhibitor and isolated in Senegal) in mass consumption food products in Senegal and West Africa, could provide new and inexpensive therapeutic options to prevent and treat miscarriage and alleviate the burden of SAM in Senegal. Keywords: Severe acute malnutrition, Breast milk, Urines, Listeria monocytogenes and Probiotics.