Soutenance de thèse de Hamadou OUMAROU HAMA

Sa riche vascularisation terminale expose la pulpe dentaire aux pathogènes bactériémiques et en fait un tissu sur lequel ont été basées les recherches paléomicrobiologiques. Nos travaux de Thèse ont montré l’infection des cellules souches de la pulpe dentaire (pour lesquelles nous avons mis au point un protocole rapide de culture et d’identification) par Bartonella quintana, agent de la fièvre des tranchées et pathogène le plus fréquemment détecté dans les pulpes dentaires anciennes; dont les cellules souches pourraient être des cellules sanctuaires. Nous avons initié la Paléovirologie des Herpesvirus humains (HHVs) dont nous avons détecté des séquences spécifiques dans un site de la Guerre de Crimée (Sébastopol, 1854) et un autre site du 18ème siècle, en détournant le protocole standard de séquençage haut débit d’ADN moderne par Novaseq; résultats confirmés chez un individu par hybridation in situ en fluorescence en ciblant le gène UL67 de HHV-6. Nous avons ensuite mis au point la paléosérologie par mini line-blot, démasquant une épidémie de fièvre récurrente dans une garnison française (16ème-17ème siècle); la présence d’anticorps d’un Coronavirus ancien non classé en cours d’investigations chez deux individus exhumés d’un site archéologique d’au moins 500 ans; et la présence d’anticorps anti-p15 kDa, p45 kDa, p47 kDa de Treponema à partir d’un fémur daté du 7-8ème siècle; diagnostic de tréponématose confirmé par PCR standard du gène p47. Notre Thèse montre l’intérêt des investigations de la pulpe dentaire par les techniques de paléosérologie que nous avons mises au point, ouvrant de nouvelles perspectives de diagnostic des maladies infectieuses anciennes et modernes.

A rich terminal vascularization exposes dental pulp to blood-borne bacterial pathogens and makes it a tissue on which paleomicrobiological researches have been based. Our Thesis work showed the infection of dental pulp stem cells (for which we developed a rapid culture and identification protocol) by Bartonella quintana, agent of trench fever and the most frequently detected pathogen in ancient dental pulps; whose stem cells could be sanctuary cells. We initiated Paleovirology of human Herpesviruses (HHVs) for which we detected specific sequences in a Crimean War site (Sevastopol, 1854) and another 18th century site, by diverting the standard protocol of modern high-throughput DNA sequencing by Novaseq; results confirmed in an individual by fluorescent in situ hybridization targeting the UL67 gene of HHV-6. We then developed paleoserology by mini line-blot, unmasking an epidemic of relapsing fever in a French garrison (16th-17th century); the presence of antibodies to an ancient yet unclassified Coronavirus under investigation in two individuals exhumed from an archaeological site at least 500 years old; and the presence of anti-p15 kDa, p45 kDa, p47 kDa antibodies to Treponema from a femur dated to the 7-8th century; diagnosis of treponematosis confirmed by standard PCR of the p47 gene. Our Thesis showed the interest of investigating dental pulp by the techniques of paleoserology that we have developed, opening new perspectives of diagnosis of ancient and modern infectious diseases.