Le financement des doctorants repose sur une variété de sources de financement telles que 
les fonds propres d'AMU et les financements externes.

Les principales catégories sont :

Le Collège Doctoral

Chaque année le Collège Doctoral d'AMU organise des concours avec des partenaires :

Concours de l'Ecole Doctorale

Chaque année l'ED organise un concours pour l'attribution des contrats doctoraux (environ 16/an).

Autres financements 

Chaque année des financements de thèses sont également proposés par les équipes de recherche  : contrats Cifre, AMidex, ANR, ERC, etc... 

Les sujets de thèse financés sont généralement disponibles sur le site web des laboratoires.